Вероятно, оно восходит к эстонскому kirss, которое в переводе на русский язык имеет значение «вишня». Согласно этому, такое прозвище мог иметь человек, который выращивал вишневые деревья или торговал их ягодами. Кроме этого, прозвище Кершен могло произойти от литовского keršas в значении «пегий; пятнистый; рябой». В этом случае подобное прозвище могло указывать на внешность основателя рода.