Фамилия Кершонков — редкая по звучанию и, скорее всего, по происхождению. Она явно образована по русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кершонков, то есть потомок Кершонка. Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Кершонок. Суффикс -онок (или -ёнок) в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин, и обычно указывает на молодость, детёныша или уменьшительность. В северных и центральных говорах, а также в белорусском и украинском влиянии, суффикс -онок давал прозвища молодым людям или сыновьям: «Кершонок» — это буквально «маленький Керш» или «сын Керша».

Корень «Керш-» — самый загадочный. Он не связан напрямую с распространёнными русскими словами. Наиболее правдоподобная версия — это искажённая или диалектная форма от имени Кирша или Керша. В русских говорах имя Кир (краткая форма от Кирилл) могло звучать как Керь, Керша. Тогда Кершонок — сын Керши (Кирилла). Такое фонетическое изменение (и вместо е, ер вместо ир) — обычное дело для народной речи. Вторая, менее вероятная версия: связь с немецкой фамилией Kersch (от диалектного Kirsche — вишня) или с топонимом Керш (например, река Керш в бассейне Дона). Но в этом случае фамилия скорее писалась бы как Кершев или Кершов, а суффикс -онок указывает на русскую, а не немецкую модель.

Географически фамилия Кершонков тяготеет к южнорусским или центральным областям, где были распространены фамилии на -онок (например, Курская, Воронежская, Тамбовская губернии). Там же встречается и фамилия Кершов, что подтверждает связь с корнем «Керш». Сословно это почти наверняка крестьянская фамилия: прозвища на -онок давали в среде, где требовалось различать отца и сына по имени, но без отчества. Дворянские фамилии с таким суффиксом практически неизвестны.

Ещё одна деталь: написание через «о» (Кершонков, а не Кершёнков) указывает на акающее произношение. В говорах, где «о» после шипящих произносили как «о», а не «ё», фамилия закрепилась в таком виде. Если бы её писали в северных областях, скорее бы появился вариант Кершёнков. Таким образом, Кершонков — это фамилия-прозвище, родившаяся в крестьянской среде, скорее всего, от имени Кирилл через диалектную форму Керша. Её редкость и нестандартный суффикс делают её ярким примером того, как живая народная речь создавала фамилии, не подчиняясь книжным правилам.