Фамилия Кессарийский — редкий пример русской фамилии, напрямую отсылающей к библейской и античной географии. В её основе лежит название древнего города Кесария, который царь Иудеи Ирод Великий построил на средиземноморском побережье современного Израиля и назвал в честь римского императора (кесаря) Октавиана Августа. Чтобы не путать этот порт с другими Кесариями, его называли Caesarea maritima (Кесария Приморская), а после превращения Иудеи в римскую провинцию Палестина закрепилось название Кесария Палестинская. В русской традиции город также именовали Цезарией, а в некоторых источниках — Кесарией Стратонийской, по имени финикийского поселения Башня Стратона, находившегося на этом месте до Ирода.

Суффикс -ский в фамилии Кессарийский указывает на её типично дворянский или духовный характер. В XVIII–XIX веках такие фамилии чаще всего получали выпускники семинарий: им давали «географические» фамилии по названиям святых мест или библейских городов. Кесария — не просто античный порт, а город, где действовали апостолы Пётр и Павел, где жил и писал историк Евсевий Кесарийский. Семинарист мог получить фамилию Кессарийский при поступлении в училище, и это не означало, что его предки жили в Палестине. Скорее всего, так нарекали за успехи в изучении Священной истории или в честь одного из отцов Церкви.

Вторая, менее вероятная версия — фамилия могла возникнуть как прозвище человека, который побывал в Кесарии или вёл с ней торговлю. Но для крестьянского сословия такое объяснение маловероятно: контакты с Ближним Востоком были редкостью, а фамилии на -ский у простых людей почти не встречались.

Двойное -сс- в корне — устойчивое написание, закрепившееся под влиянием церковнославянской традиции (ср. Кессарийский с ударением на второй слог). Встречаются и варианты Кесарийский, Кессарьев, но форма Кессарийский — наиболее книжная, семинарского происхождения.

Процесс формирования фамилий был длительным, и точно определить, когда и где конкретный род Кессарийских получил свою фамилию, можно только на основе серьёзных генеалогических изысканий. Однако ономастика даёт надёжную подсказку: носитель этой фамилии почти наверняка происходил из духовного сословия, а его предок-семинарист взял себе «громкое» имя в честь древнего города апостольских времён.