Фамилия Кесарин — редкий случай, когда за привычным славянским суффиксом -ин скрывается основа, уводящая нас в Византию и Древний Рим. Вопреки интуиции, корень здесь не «кесарь» в прямом значении «император», а церковное имя Кесарь (церковнославянская форма от латинского Caesar). Это имя носили несколько раннехристианских святых, и в святцах оно встречается, хоть и не часто. Таким образом, Кесарин — типичная «именная» фамилия: её получили потомки человека по имени Кесарь. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Кесарев, то есть сын Кесаря.

В русской ономастике есть параллельные формы: Кесарев (с суффиксом -ев, более распространённая) и Кесаринский (с топонимическим суффиксом). Кесарин — вариант, закрепившийся, скорее всего, в южнорусских или украинских говорах, где имя Кесарь было чуть более употребительно. Встречается он редко, и это не случайно: имя Кесарь никогда не было массовым, а фамилии от него образовывались точечно, в конкретных семьях.

Интересно, что носители фамилии Кесарин могли происходить из духовного сословия. В среде священников и монахов нередко давали «календарные» имена, в том числе редкие, и дети таких священнослужителей получали фамилии по имени отца. Впрочем, не исключён и бытовой вариант: в крестьянской среде мальчика могли назвать Кесарем в честь святого, а его внуки уже стали Кесариными. Географически фамилия тяготеет к регионам бывшей Киевской губернии и югу России, но точных статистических данных по ней мало — она остаётся штучной.

Словообразовательная модель проста: основа Кесар- плюс суффикс -ин. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Кесари́н, хотя в разговорной речи встречается и вариант с ударением на первый слог, что сближает фамилию с притяжательным прилагательным. Споров о происхождении здесь нет: все версии сходятся к имени Кесарь. Версия о прозвище «кесарь» (в смысле «важный, гордый человек») менее правдоподобна, так как прямых прозвищ от титулов в русской традиции почти не бывает — их заменяли ироничные формы вроде «Царёк».