Фамилия Хабаткова — редкий случай, когда географический ключ оказывается едва ли не важнее этимологического. Если отбросить очевидные версии, которые приходят на ум в первую очередь, и посмотреть на карту распространения, картина вырисовывается довольно определённая.

Самое правдоподобное объяснение — фамилия имеет севернорусское или уральское происхождение. Суффикс -ов(а) в женской форме указывает на принадлежность к роду, а основа «Хабатк-» образована от прозвища или мирского имени Хабаток. В архангельских и вологодских говорах словом «хабат» (или «хабаток») называли небольшой клок, обрывок, клочок ткани, а также нечто негодное, изношенное. Прозвище Хабаток мог получить человек небрежного вида, носивший рваную одежду, либо, напротив, мастер, работавший с лоскутами — например, портной или скорняк, занимавшийся починкой. В пользу «ремесленной» версии говорит и то, что на Русском Севере и в Приуралье фамилии на -ов от подобных прозвищ (Лоскутов, Клоков) были вполне обычны.

Менее вероятна, но допустима связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть слово «хабат» (забота, хлопоты), а также имя Хабат (от арабского «хабиб» — любимый, друг). Однако суффикс -к- в основе (Хабат-к-ова) нехарактерен для тюркских моделей образования русских фамилий. Скорее всего, это русский уменьшительный суффикс, превративший прозвище Хабат в Хабаток, а затем фамилию — в Хабатков.

Особенность написания — ударение, вероятнее всего, падает на второй слог: Хабáткова. Встречается и вариант с ударением на первый слог (Хáбаткова), но он менее типичен для фамилий с таким суффиксом. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла записываться через «о» в суффиксе (Хабаткова) или с одной «т» (Хабаткова), но путаницы с двойной согласной обычно не возникало.

Таким образом, предок носительницы фамилии Хабаткова с высокой долей вероятности жил на севере европейской части России или на Урале, и его прозвище было связано либо с внешним видом, либо с ремеслом, требовавшим работы с тканью. Сословная принадлежность — скорее всего, крестьянство или мещанство, поскольку фамилии от прозвищ с «бытовой» семантикой редко встречались у дворянства.