Фамилия Хабинова — женская форма фамилии Хабинов, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем или прозвищем. Основа здесь — «Хаби́н», что в русской ономастике почти всегда восходит к арабскому имени Хабиб (в переводе — «любимый», «друг»). Имя Хабиб широко распространено у народов, исповедующих ислам: у татар, башкир, народов Кавказа, а также у арабов. В русской среде фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а, -я, но здесь мы видим редкий случай: тюркская или арабская основа «Хабиб» в разговорной речи могла утратить конечный согласный и превратиться в «Хаби́», а затем, при русификации, получить типичный русский суффикс -н- и окончание -ов. Получается цепочка: Хабиб → Хаби́н → Хабинов. Суффикс -ин в фамилии Хабинова указывает на принадлежность: «дочь (или жена) Хабина».

Вторая, менее вероятная версия — связь с диалектным русским словом «хабить» (портить, губить) или «хабалка» (грубая женщина), но это чисто народная этимология: фамилия Хабинова почти не встречается в исконно русских регионах, зато частотна в Татарстане, Башкортостане и среди кавказских народов. География бытования — главный аргумент в пользу арабского корня.

С точки зрения словообразования, фамилия Хабинова интересна тем, что её мужская форма Хабинов — нестандартная. Обычно от имени Хабиб образуют фамилию Хабибов (с суффиксом -ов), но вариант Хабинов — результат адаптации через промежуточное прозвище Хабин. Такое встречается в среде, где имена адаптировали под русские модели: например, татарин Хабиб в документах мог быть записан как Хабин, а его дети уже получали фамилию Хабиновы. Это типичный пример «обрезания» восточного имени до русской основы, чтобы легче вписать его в систему отчеств и фамилий XIX века.

Если искать социальный контекст, то носители фамилии Хабиновы в дореволюционной России — это в основном крестьяне и мещане из Поволжья и Приуралья. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В советское время фамилия распространилась шире, но сохранила региональную привязку к национальным республикам. Сейчас Хабинова — нередкая фамилия среди татар, башкир и ингушей.