Фамилия Хабукин — один из тех случаев, где с первого взгляда неясно, с какого языка начинать разгадку. Самая вероятная версия — адыгское (черкесское) происхождение. В адыгских языках есть основа «хьэбу» или «хьэбжьу», что может означать «мелкий», «дробный», а также встречается в составе личных имен. Суффикс «-ин» в этой модели не типичный русский патронимический (чей сын), а скорее адаптация адыгского притяжательного окончания при русификации фамилии. То есть Хабукин — это «принадлежащий к роду Хабуковых» или «сын Хабука».

Мужское имя Хабук (или Хабуко) действительно встречается у адыгов и шапсугов. Оно могло быть прозвищем, данным человеку невысокого роста или обладающему быстрыми, «мелкими» движениями. В пользу этой версии говорит и география фамилии. Хабукины — не случайные носители по всей России. Они плотно закреплены в Краснодарском крае, особенно в Туапсинском районе и в аулах, где исторически жили адыги-шапсуги. Встречается фамилия и у кабардинцев.

Менее вероятно, но не исключено, что корень «хабук» мог прийти через тюркские языки. Например, в ногайском или кумыкском «хабук» — разновидность растения или, в переносном смысле, «сухой, тощий». Однако адыгская версия убедительнее и по географии, и по частоте бытования.

Интересно, что фамилия не получила широкого распространения за пределами Кавказа. Это говорит о том, что она сохранила локальную привязку и не «растворилась» в общерусском ономастиконе. В дореволюционных метрических книгах по Черноморской губернии Хабукины записаны как горцы, принявшие православие, но сохранившие родовое имя. Таким образом, предки носителя этой фамилии, скорее всего, были черкесскими крестьянами или воинами, а сама фамилия — прямая отсылка к имени основателя рода, человека по прозвищу Хабук.