Фамилия Хаджилий — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия, а религиозный статус, причём с явным восточным колоритом. Корень «хаджи» (или «хаджий») восходит к арабскому «хаджи» — почётному титулу мусульманина, совершившего паломничество (хадж) в Мекку. В тюркских и кавказских языках это слово закрепилось как прозвище или даже как часть составного имени. Суффикс «-лий» в этой фамилии — типичный тюркский аффикс принадлежности, который в русской передаче часто даёт окончание «-ий». Он отвечает на вопрос «чей?» или «относящийся к кому?», то есть Хаджилий буквально означает «принадлежащий хаджи», «из рода хаджи».

Скорее всего, фамилия сложилась на территориях, где долгое время переплетались тюркские и славянские ономастические традиции — в Крыму, на Северном Кавказе, в Причерноморье или в южнорусских степях. В этих регионах титул «хаджи» был широко распространён, а запись прозвища с суффиксом «-лий» в документах Российской империи постепенно превращала его в наследственную фамилию. Например, у крымских татар, гагаузов или болгар встречаются аналогичные модели: Хаджиев, Хаджиоглу, Хаджийский. Форма Хаджилий стоит в этом ряду особняком, сохраняя архаичный тюркский аффикс, который редко переходил в русские фамилии в чистом виде.

Версия о происхождении от греческого «хаджи» (той же арабской основы, но через православную традицию — так называли паломников в Иерусалим) менее вероятна. У греков и молдаван такие прозвища обычно оформлялись суффиксами «-у» или «-оглу», а «-лий» — почти исключительно тюркский маркер. Поэтому основная гипотеза: предок носителя фамилии был либо сам хаджи, либо его сын или слуга, получивший прозвище по уважаемому старшему.

Фамилия крайне редкая. В современных базах данных она встречается единично, чаще всего у носителей с корнями из Крыма, Краснодарского края или Ростовской области. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках её можно найти в записях о крещёных татарах или переселенцах из Османской империи. Поскольку фамилия не прошла массовую русификацию через суффикс «-ов», она сохранила свой первоначальный облик — и это главная подсказка для тех, кто ищет свои корни: искать нужно не в центральной России, а в южных регионах, где тюркское влияние было сильным.