Фамилия Ханапова — женская форма, а её мужской вариант — Ханапов. Это довольно редкая фамилия, и её происхождение не лежит на поверхности, что делает разбор особенно интересным. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского корня, образованная по русской модели с суффиксом -ов.

В основе фамилии лежит личное имя или прозвище Ханап. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) имя Ханап может быть вариантом арабского имени Ханафи — от названия одного из четырёх суннитских мазхабов (правовых школ), ханафитского. Человек, носивший такое имя, мог быть потомком приверженца этого толка ислама. Другой вариант: имя Ханап — это стяжённая форма от Ханапей (где «пей» — господин, бек), то есть «хан-господин», что указывало бы на знатное происхождение или высокий статус предка.

Суффикс -ов в фамилии Ханапов — типичный русский патронимический суффикс, который в XVI–XVII веках активно присоединяли к тюркским основам при переходе на русскую фамильную модель. Это говорит о том, что предки носителей фамилии жили в смешанной среде, вероятнее всего, в Поволжье или Приуралье, среди татар, башкир или мишарей, которые после вхождения в состав Русского государства постепенно встраивались в систему русских фамилий.

Встречается фамилия Ханапов и в среде крещёных татар (кряшенов), где она могла закрепиться без прямой связи с исламским значением имени — просто как семейное прозвище. В любом случае, географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану и Оренбургской области. Написание с буквой «а» в первом слоге (Ханапов, а не Хонопов) указывает на сохранение тюркского произношения.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Ханапов стоит в одном ряду с Ханафиным (от той же основы Ханафи), Ханаевым или Хановым, но отличается более редкой и архаичной формой имени-основы. Социальный статус предков, скорее всего, был крестьянским или мещанским — фамилия не дворянская, что типично для поздних (XVIII–XIX веков) фамилий тюркского происхождения в русской среде.