Фамилия Ханат — редкий случай в русском ономастиконе, где основа не славянская, а, скорее всего, тюркская или арабская, а суффикс отсутствует. Это сразу отличает её от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ев или -ин. В русской традиции фамилии без суффикса (так называемые «чистые» основы) обычно указывают на позднее происхождение или на иноязычное происхождение носителя, которого записали «как слышали», без русификации.

Самое вероятное объяснение — прозвище Ханат восходит к тюркскому слову «ханат» (крыло, сторона, фланг). В языках тюркской группы (татарский, башкирский, казахский) это слово имеет значение «крыло» в прямом смысле, а также «сторона» или «опора». В кочевой среде прозвище Крыло могли дать быстрому, лёгкому человеку, либо тому, кто был «правой рукой» — опорой семьи или рода. Сравните с татарскими фамилиями Канат, Канатов — они того же корня.

Вторая версия, менее распространённая, но тоже возможная, — арабское имя Ханат (женское имя, означающее «нежность», «мягкость»). В таком случае фамилия могла возникнуть от имени матери или бабушки, что случалось в смешанных семьях или при записи по материнской линии. Однако для русской фамильной модели это нетипично: фамилии от женских имён встречаются реже (например, Марьин, Аннин), и Ханат в этом ряду стоит особняком.

Географически фамилия Ханат встречается в основном в Татарстане, Башкортостане, а также среди казахов и народов Северного Кавказа. В центральных русских областях она практически не фиксируется. Это подтверждает версию о тюркском корне: фамилия могла возникнуть у татарских или башкирских крестьян при окончательном закреплении фамилий в XIX — начале XX века.

Любопытная деталь: фамилия Ханат не имеет типичного русского окончания, поэтому в документах её могли склонять по-разному. В советское время при паспортизации носителей часто записывали без изменений, что закрепило форму как несклоняемую, хотя по правилам тюркские фамилии на согласный склоняются (Ханата, Ханату). Если вы встретили фамилию в старых метрических книгах, велика вероятность, что предка записали просто по прозвищу, без добавления «-ов» или «-ин», что и делает эту фамилию своего рода «чистым слепком» с прозвища.