Фамилия Харабарина звучит редко и сразу привлекает внимание необычной основой. Это женская форма фамилии Харабарин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или именем предка.

Самый вероятный корень фамилии — диалектное слово «харабара» или «харабор». В русских говорах, особенно в южных и центральных областях, «харабора» (или «хорабора») означала шум, гам, суматоху, беспорядок, а также ссору или перебранку. Человека, который постоянно суетился, шумел, затевал споры или был непоседой, могли прозвать Харабора или Харабар. От этого прозвища и образовалась фамилия Харабарин (притяжательное «чей?» — сын Харабары), а от неё — Харабарина.

Суффикс -ин указывает на принадлежность к роду: первоначально Харабарина означало «жена Харабарина» или «дочь Харабарина». В русской традиции фамилии на -ин обычно образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я, что полностью совпадает с прозвищем Харабара.

Есть и более редкая, но возможная версия, связывающая фамилию с тюркскими корнями. В тюркских языках «хара» означает «чёрный», а «бар» — «есть, имеется». В таком случае прозвище могло означать «чёрный есть» или «имеющий чёрное», но эта гипотеза менее убедительна для русской фамилии, так как слово «харабара» — исконно русское диалектное, и именно оно лучше всего объясняет и звучание, и значение.

Географически фамилия Харабарин (и Харабарина) встречается преимущественно в южнорусских регионах, а также в Поволжье — там, где диалектное слово «харабора» было в ходу. Носители фамилии могли быть крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище за живой, беспокойный нрав или склонность к шумным спорам.