Фамилия Херкин — один из тех редких случаев, когда её основа лежит на поверхности, но вызывает вопросы из-за случайного созвучия. На самом деле, ничего общего с обсценной лексикой здесь нет. Фамилия образована от крестильного имени Херувим (церковное Херувимъ), которое в бытовой речи часто сокращали до Херя, Херка. В старину имена по ангельским чинам (Серафим, Херувим) давали нередко, особенно в монашеской среде, но встречались они и у мирян. Уменьшительная форма Херка стала прозвищем, а от него по стандартной восточнославянской модели появилась фамилия Херкин — буквально «сын Херки».

Суффикс -ин указывает на принадлежность: чей? — Херкин. Такая модель типична для фамилий, образованных от основ на -а/-я. В документах XVII–XVIII веков можно встретить варианты написания: Херкин, Херькин, Херувимов. Последняя форма — более полная и книжная, а Херкин — народный, разговорный вариант, который закрепился в крестьянской и мещанской среде.

Географически фамилия встречается редко, но не единично. Основные очаги — Центральная Россия и Поволжье. Встречается она и среди старообрядцев, которые часто сохраняли архаичные имена. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» Херкин не упоминается, но однокоренные Херувимов и Херувимский там есть — это подтверждает церковное происхождение основы.

Стоит добавить, что в некоторых говорах слово «херь» имело и диалектное значение — «хилый, слабый человек», но для фамилии Херкин эта версия менее вероятна: имя Херувим даёт более прямое и документально подтверждаемое объяснение. Так что предки носителя фамилии Херкин, скорее всего, были людьми верующими, и имя им дали в честь ангельского чина — без всякого второго дна.