Фамилия Херкунов — редкий случай, где основа ясна, а вот её происхождение вызывает вопросы. Разберёмся с корнем.

В основе лежит слово «херук» или «херкун». В русских говорах, особенно северных и сибирских, так называли человека, который много и попусту хвастается, пускает пыль в глаза, говорит с претензией, но без дела. Глагол «херучить» — значит хвастать, бахвалиться. Так что Херкунов — это потомок того, кого прозвали Херкун, то есть хвастун. Прозвище незлое, скорее бытовое, с насмешкой — «ну ты и херкун».

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Херкуна). Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Херкуно́в, хотя в устной речи возможны варианты.

Интересно, что есть и другая, менее вероятная версия. В некоторых говорах «херуком» могли называть человека с хриплым, сиплым голосом (от слова «херкать» — хрипеть, кашлять). Но связь с хвастовством выглядит убедительнее — в народной ономастике прозвища по характеру встречаются гораздо чаще, чем по физическим недостаткам.

Фамилия редкая, географически привязана к северным регионам России (Архангельская, Вологодская области) и к Сибири, куда переселенцы вывозили диалект. В дворянских родословных книгах Херкуновы не значатся — фамилия явно крестьянская или мещанская, образованная на месте, а не через семинарию.

Однокоренных фамилий почти нет. Встречается разве что Херуков (от той же основы, но без суффикса деятеля -ун). Так что Херкунов стоит особняком — прозвище, которое когда-то дали за словоохотливость и любовь к приукрашиванию, закрепилось и дошло до наших дней.