Фамилия Ходжиханов образована от мужского имени Ходжихан, которое восходит к двум основам. Первая из них - персидское мужское имя Ходжа, которое в переводе на русский язык означает «хозяин, владелец, господин», «обладающий большими знаниями, наставник, учитель». Вторая часть имени восходит к тюркскому «хан» - «властитель, монарх».