Фамилия Хонин образована от мужского древнееврейского имени Хони, которое в переводе на русский язык означает «любимчик, любимец». Имя Хони носил законоучитель и чудотворец, знаменитый своей праведностью, герой нескольких историй, приводимых в Талмуде. Согласно другой гипотезе, фамилия Хонин имеет славянское происхождение и ведет свое начало от прозвища Хоня, восходящего к русскому диалектному глаголу «хонькать» - «тужить, горевать, охать, плакаться». В таком случае Хоней могли прозвать человека с тяжелой судьбой. Однако, скорее всего, Хоня – это охранительное внутрисемейное прозвище, выполняющее функцию оберега. В данном случае, надеясь иметь счастливого, благополучного мальчика, родители назвали его Хоней. Ашкеназские фамилии оформляются формантами -сон/-зон (в буквальном переводе «сын»), -ман («человек, мужчина, муж»), -кинд («ребенок»), -бейн («кость»), -штам («ствол»), -ер, -с. Горские евреи Кавказа при образовании фамилий заимствовали грузинский фамильный суффикс –швили (переводится как «дитя»). Евреи Израиля часто имеют фамилии, оформленные еврейскими суффиксами принадлежности –ис/-ес, -и, приставкой бен- (в переводе с иврита «сын») и артиклем принадлежности к роду Га-.