Фамилия Хопто — явление нечастого, но выразительного типа. В ней нет привычного русского суффикса, поэтому сразу понятно: это не «Хоптов» и не «Хоптин». Фамилия застыла в форме, которую дало прозвище или имя, и не менялась столетиями. Такие фамилии в русской среде почти всегда иноязычного происхождения.

Главная версия ведёт в тюркские языки. Слово «хопто» могло означать «быстрый», «проворный» или «ловкий» (ср. с казахским «қопты» — «вскочил», «поднялся»). Прозвище Хопто могли дать человеку резкому в движениях, непоседливому или тому, кто быстро принимал решения. Вторая, менее распространённая гипотеза связывает фамилию с бурятским или монгольским «хобто» — «ящик», «сундук». В таком случае прозвище мог получить мастер, делавший сундуки, или торговец, который возил товары в ящиках. Слабая версия о связи с немецким «Hoft» (двор) не выдерживает критики: в фамилии нет немецкого окончания, а корень нехарактерен для фамилий поволжских немцев.

Географически фамилия Хопто встречается в Забайкалье, Бурятии и Иркутской области. Это подтверждает её вероятное бурятское или тюркское происхождение. В XIX веке такие фамилии часто записывали у казаков и крестьян, живших рядом с бурятскими родами — прозвище могло прийти в русскую среду через смешанные браки или соседское общение.

Морфология фамилии проста: основа «хопто» без суффикса. Это указывает на то, что фамилию не русифицировали — не добавляли -ов или -ин. Такое случалось, если носитель долго сохранял прозвище в быту, а при переписи записали именно прозвищную форму. Сейчас фамилия остаётся редкой, и её носители почти наверняка имеют корни в Восточной Сибири.