Фамилия Хромагин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет очевидного корня, указывающего на профессию или географическое название, поэтому главная загадка — в основе. Скорее всего, она образована от прозвища или неканонического имени Хромага, а тот, в свою очередь, связан с прилагательным «хромой» или глаголом «хромать». Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Хромаги, то есть потомок человека, которого прозвали Хромагой.

Здесь важно разобраться с формой. Прозвище Хромага — это не просто «хромой человек». Уменьшительно-уничижительный суффикс -аг(а) в русских говорах (сравните: бедняга, работяга, миляга) придавал слову оттенок снисходительности или бытовой оценки. Хромагой могли назвать не только того, кто прихрамывал, но и человека с неровной, «ковыляющей» походкой, возможно, из-за привычки или старой травмы. В некоторых диалектах слово «хромой» имело и переносное значение — «неуклюжий», «нескладный», что расширяет круг возможных носителей прозвища.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с греческим именем Хромак (от χρώμα — «цвет», «краска»). Такие имена изредка встречались в среде духовенства, но для фамилии с русским суффиксом -ин это нетипично. Обычно фамилии на -ин от греческих основ образуются напрямую (например, Хромов), а не через промежуточную форму на -аг.

Фамилия Хромагин — пример того, как простое на вид прозвище, описывающее внешнюю особенность, закрепилось в родовом имени. Она могла возникнуть в среде крестьян или посадских людей центральной России, где прозвища на -ага были особенно распространены. Сейчас это редкая фамилия, и её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких разрозненных родов, не связанных общим предком.