Фамилия Хромагина — женская форма, а мужская — Хромагин. В основе лежит необычное для современного слуха прозвище или имя Хромага. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Хромаги. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на -а или -я.

Корень хром- сразу отсылает к физическому недостатку — хромоте. Прозвище Хромага могли дать человеку, который прихрамывал. В старых говорах слово «хромага» означало не просто хромого, а того, кто хромает сильно, заметно, возможно, с детства. В отличие от нейтрального «хромец», «хромага» звучало более экспрессивно, даже несколько уничижительно, как «кривоногий» или «колченогий». Однако в крестьянской среде такие прозвища давали без злого умысла — по самому яркому внешнему признаку, и они легко становились фамилиями.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «хромать» в переносном смысле — «вести себя нерешительно, колебаться». Тогда Хромага — прозвище нерешительного, медлительного человека. Но в пользу первой, «физической» версии говорит то, что подавляющее большинство русских прозвищ на -ага/-яга (Вертяга, Бродяга, Рваняга) описывали конкретные действия или свойства, а не черты характера в отвлечённом смысле.

Фамилия встречается в центральных и северных областях России, но не часто. В дореволюционных переписях Хромагины записаны в основном как крестьяне и мещане. В дворянских родословных книгах эта фамилия не значится — её носители были людьми простого звания, и фамилия закрепилась за ними в эпоху массового присвоения фамилий в XVIII–XIX веках.

Интересно, что при всей прозрачности корня фамилия не получила широкого распространения. Возможно, потому, что прозвище было слишком прямым и обидным, и его старались не передавать детям. Но в тех семьях, где фамилия устоялась, она стала нейтральным родовым именем — как тысячи других «говорящих» русских фамилий.