Фамилия Худиярова — женская форма фамилии Худияров. Её основа — тюркское мужское имя Худияр, которое в переводе с персидского (через тюркское посредничество) означает «друг Бога» или «любимец Бога» (Худа — Бог, яр — друг, возлюбленный). Имя было распространено у народов, исповедующих ислам, в Поволжье, Средней Азии и на Кавказе. Фамилия образована по русской модели: к основе Худияр добавлен патронимический суффикс -ов (в женском варианте — -а), что означает «сын Худияра». Встречаются варианты написания: Худияров, Худиярова, а также более редкая форма Худияр.

По географии бытования фамилия Худияров (и Худиярова) характерна для татарской и башкирской среды, а также встречается у народов Дагестана. В переписях XIX века носители фамилии фиксировались в Казанской, Уфимской и Оренбургской губерниях. Предки могли быть крестьянами, ремесленниками или служилыми людьми, получившими фамилию по имени отца. В отличие от многих русских фамилий на -ов, эта не связана с прозвищем или профессией — она чисто патронимическая и восходит к личному имени с религиозным смыслом.

Любопытная деталь: в русском языке ударение в фамилии плавающее. В татарской среде его чаще ставят на последний слог — Худияро́ва, а в русскоязычной — на третий: Худи́ярова. В документах советского времени встречается написание через букву «е» — Худеяров, что отражает редукцию безударного «и» в устной речи.