Фамилия Худякова напрямую связана с мирским именем Худяк. Так в старину называли не только истощённого или болезненного человека, как можно подумать. Гораздо чаще слово «худяк» имело социальный оттенок и обозначало бедняка, человека скудного достатка. В этом смысле прозвище было не насмешкой над внешностью, а характеристикой имущественного положения, что для крестьянской среды XVI–XVII веков было делом обычным.

Письменные источники сохранили имена реальных носителей этого прозвища. Известны тверской помещик Худяк Мерлин (середина XVI века), Худяк Евсилий (тоже середина XVI века) и Фёдор Данилович Худяк Загряжский, упомянутый в 1602 году. Последний пример особенно показателен: прозвище Худяк встречалось даже в среде служилого дворянства, а не только среди крестьян или посадских людей. Это говорит о том, что имя не считалось оскорбительным или унизительным, а просто фиксировало какую-то заметную черту человека.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: к основе Худяк добавили суффикс -ов, а затем родовое окончание -а. Такую форму получили потомки человека по прозвищу Худяк, и она закрепилась за семьёй. Интересно, что мужской вариант Худяков и женский Худякова — это одна и та же фамилия, просто в русской традиции жена и дочери носили форму женского рода.

У фамилии есть и «родственники» — однокоренные фамилии Худяков, Худяев, Худов, Худоногов. Все они восходят к тому же корню «худ-», но каждое прозвище подчёркивало свою деталь: бедность, слабость, неудачливость. В сравнении с ними Худякова выглядит самой прямой и прозрачной по смыслу: она буквально говорит, что предок носил имя Худяк, и это имя было ему дано не случайно, а по какому-то явному признаку.

Сегодня фамилия Худякова распространена по всей России, и её носительницы вряд ли задумываются о том, что их далёкие предки жили скромно, а то и в нужде. Но именно такие «неблагозвучные» на первый взгляд прозвища часто становились основой фамилий и сохраняли память о реальной жизни людей — с их достатком, внешностью и характерами.