Фамилия Кибакин — один из тех случаев, когда на слух кажется, что перед нами что-то тюркское, а на поверку выходит исконно русское прозвище. Основа здесь — слово «кибака» или «кибак». В северных и центральных русских говорах так называли небольшую рыбку, обычно снетка или мелкую плотву. Соответственно, Кибака — прозвище невысокого, щуплого человека или же рыбака, который промышлял именно такой мелочью. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — сын Кибаки, человек из рода Кибакиных.

Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков, особенно для крестьянской и посадской среды. В отличие от дворянских фамилий на -ов/-ев, которые часто строились от полных церковных имён, фамилии на -ин охотно брали за основу прозвища, причём нередко обиходные, даже сниженные. Кибакин — фамилия именно из этого ряда: простая, бытовая, без претензии на знатность.

Есть и другая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование. В некоторых диалектах «кибака» означала не только рыбу, но и кивок, движение головой вниз — отсюда могли прозвать человека, который постоянно кивает, кланяется или имеет привычку дёргать головой. Однако связь с рыбой подкрепляется тем, что фамилия встречается в регионах, где рыболовство было основным промыслом: в Поволжье, на Севере, в Ярославской и Костромской областях.

В ономастических справочниках Кибакин не относится к числу широко распространённых фамилий. Она редкая, локальная, не попавшая в массовую волну фамилий XIX века из-за того, что исходное прозвище уже тогда вышло из активного употребления. Если вы встретили Кибакина, с высокой вероятностью его корни — в небольшом селе или деревне, где несколько поколений мужчин носили прозвище по рыбацкому делу или по внешности.

Интересно, что в некоторых переписных книгах XVII века встречается написание «Кибаков» — вариант с суффиксом -ов, который мог возникнуть под влиянием более распространённой модели. Но именно форма Кибакин сохранилась как более архаичная, прямо указывающая на прозвище отца.