Фамилия Киндерская — одна из тех, что заставляет задуматься о происхождении, и у неё есть как минимум две версии. Первая, и самая распространённая, связывает её с германским именем Гюнтер. В древнегерманском языке это имя складывалось из двух основ: gund («битва, сражение») и heri («войско»). То есть Гюнтер — это «воинство для битвы». Фамилия Киндерская, по этой версии, образована от варианта этого имени — Киндер, которое могло попасть в русскую среду через балтийских немцев или через контакты с немецкими колонистами. Суффикс -ск- указывает на то, что фамилия сформировалась по модели, характерной для польской, украинской или белорусской традиции, где такие окончания означали принадлежность к роду или местности.

Вторая версия — топонимическая. Фамилия могла произойти от прозвища Киндерский, которое давали выходцу из деревни Киндарская в Рязанской области. В этом случае фамилия указывает не на имя предка, а на место его рождения или проживания. Такое объяснение менее экзотично, но вполне логично: в русских говорах названия деревень часто становились основой для фамилий с суффиксом -ск-.

Исторические документы подтверждают, что носители фамилии жили на западе Российской империи. В источниках упоминаются Юлия Ивановна Киндерская, родившаяся в 1902 году в Двинске (ныне Даугавпилс, Латвия), и Карл Иванович Киндерский, родившийся в 1887 году в Волынской губернии Дубинского уезда. Оба случая — мужские и женские варианты фамилии — фиксируют её бытование в регионах со смешанным населением, где пересекались славянские, балтийские и немецкие традиции именования.