Фамилия Киндрашина образована от мужского крестильного имени Кондратий. В переводе с латинского (Condratus) оно означает «четырехугольный» или «широкоплечий» — такие имена нередко давали в знак пожелания физической силы. В основу фамилии легла не полная форма имени, а его производная, распространенная у украинцев и белорусов, — Киндраша. Это типичная восточнославянская модель: от обиходного прозвища-имени с помощью суффикса -ин (Киндраша → Киндрашин) образовали фамилию, буквально означающую «чей?» — «сын Киндраши». Суффикс -ин характерен для фамилий, произошедших от основ на -а/-я, и в русской традиции обычно указывает на принадлежность к роду.

Скорее всего, основатель рода Киндрашиных был человеком из простого сословия: в крестьянской и мещанской среде чаще пользовались именно уменьшительными и обиходными формами крестильных имен, а не их полными церковными вариантами. Фамилия Киндрашина — женская форма, а мужской вариант — Киндрашин. Встречается она преимущественно в регионах, исторически связанных с украинским и белорусским влиянием: на юге и юго-западе России, а также в приграничных областях. Редкость фамилии делает её хорошим маркером локального происхождения — в отличие от массовых Кондратовых и Кондратьевых, Киндрашины почти всегда выводят род из одной местности.