Фамилия Киндра чаще всего происходит от имени Кондратий. Мужское крестильное имя Кондратий в переводе с латыни означает «четырехугольный» или «широкоплечий». В основе фамилии лежит не полная, а производная форма этого имени — Киндра. Такая форма особенно распространена среди украинцев и белорусов. Имя Кондратий носил раннехристианский святой, проповедовавший в Афинах и Магнезии: он разрушал идолов, изгонял бесов, за что подвергался гонениям. Скорее всего, основатель рода Киндры был человеком из простого сословия — фамилии на -а без суффикса часто закреплялись за крестьянами и мещанами.

Есть и другая версия, хотя она менее вероятна. Фамилия Киндра могла образоваться от немецкого слова Kind (Kinder), то есть «ребенок, дитя». В этом случае родоначальника могли прозвать Киндрой за многодетность. Либо же так в шутку называли взрослого мужчину, который по каждому поводу обращался за советом, словно малый ребенок, неспособный принять решение самостоятельно. Славянская версия выглядит убедительнее: на территориях современной Украины и Беларуси фамилии от имени Кондратий встречаются часто, а немецкое влияние там было слабее.

Окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Киндры можно лишь на основании глубоких генеалогических разысканий. Ясно одно: процесс формирования фамилий был длительным, и в разных ветвях одного рода значение могло отличаться.