Фамилия Киргетов происходит от прозвища Киргет. Его основа, скорее всего, связана с диалектным словом «кирега» — так в оренбургских говорах называли решётки или стенки кочевой кибитки. Это указывает на профессиональное прозвище: предок мог заниматься изготовлением или ремонтом кибиток и экипажей. Такая версия выглядит правдоподобнее, поскольку опирается на конкретный бытовой предмет и ремесло, распространённое в степных регионах.

Есть и другая гипотеза — от киргизского глагола «киргенси», что дословно означает «делать вид, что входишь». Если принять эту версию, прозвище Киргет могло характеризовать человека хитроватого, неискреннего, склонного к притворству. Однако тюркская основа здесь менее надёжна: глагол не образует типичных для русских прозвищ форм, и звуковое совпадение может быть случайным.

Сама фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ов, что характерно для русских фамилий, возникших от прозвищ на твёрдый согласный. Потомок человека по прозвищу Киргет стал Киргетовым. Фамилия редкая, географически тяготеет к юго-восточным областям России, где исторически были сильны контакты с кочевыми народами.