Фамилия Кисамеева — один из тех случаев, когда внешне простая основа таит неочевидный корень. На первый взгляд кажется, что перед нами типичная фамилия на -еев, образованная от имени или прозвища Кисамей. Но если присмотреться, выясняется, что суффикс -еев здесь присоединён к основе, которая сама по себе уже содержит элемент, похожий на окончание. В русской ономастике это не редкость: фамилии вроде Кисамеева, Китаева или Каратаева возникали, когда прозвище на -ай, -ей адаптировали под стандартную модель патронимического суффикса.

Корень «Кисам» — самый спорный и интересный момент. Вероятнее всего, он восходит к тюркскому или арабскому имени Кисам (вариант — Кысам), что значит «раздел, доля, часть». В мусульманской традиции так могли назвать ребёнка, родившегося после долгого ожидания или в сложный период — как знак «выделенной судьбой доли». В русских документах XVI–XVII веков такие имена нередко фиксировали у служилых татар, выходцев из Казанского или Астраханского ханств, которые переходили на русскую службу и получали поместья. Отсюда же, кстати, фамилия Кисаев — более распространённая, но того же гнезда.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «киса» (кошель, мешок) или «кислый». Тогда Кисамей могло быть прозвищем человека, носившего кису (торговца, сборщика податей) либо обладавшего кислым выражением лица. Однако в таком случае фамилия скорее писалась бы через «с» (Кисамеев), а не через «з» — но в старых документах орфография была неустойчивой, и тюркское «с» часто передавали русским «с» или даже «з».

Географически фамилия Кисамеева редкая. В современных базах она встречается преимущественно в Поволжье — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области, а также среди потомков татарских мурз, переселившихся в XIX веке в Сибирь. Это указывает на то, что предки носителя фамилии, скорее всего, были не крестьянами, а служилыми людьми или торговцами — в крестьянской среде такие «книжные» тюркские имена приживались реже.

Интересная деталь: ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Кисаме́ева, хотя в устной речи нередко смещается на третий. Это типично для фамилий с суффиксом -еев, где ударение «плавает» в зависимости от региональной традиции произношения.