Фамилия Кишкова — женская форма фамилии Кишков, которая образовалась от прозвища Кишка. В «Толковом словаре живого великорусского языка» В. Даля слово «кишка» означает «длинный, извилистый и узкий рукав, в теле животного». Чаще всего такое прозвище давали человеку худощавого телосложения и высокого роста — по внешнему сходству с длинным и тонким органом.

Однако есть и другая версия, связанная с географией. В Тверской области «кишкой» называли извилины и излучины реки. Если предок жил возле крутого поворота речного русла, соседи могли прозвать его Кишкой по месту жительства. Такие прозвища были удобны в быту: они точно описывали человека или его двор, а со временем закреплялись за родом.

Суффикс -ов- в основе Кишков указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ. Потомка Кишки называли «Кишков сын», а затем это именование перешло в фамилию. Фамилия Кишкова встречается реже, чем Кишков, что говорит о её происхождении от конкретного родового гнезда, а не от массового прозвища.

Фамилия хранит память о том, как в старину ценили меткое слово: одно прозвище могло заменить длинное описание внешности или места, а потом передавалось детям как фамильное имя.