Фамилия Кишковаров — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её, нужно разобрать слово по частям, и здесь нас ждёт неожиданный поворот. Основа «Кишковар» скорее всего не славянская, а тюркская или иранская, а суффикс «-ов» — уже русский патронимический, указывающий на принадлежность («чей?» — Кишковаров сын). Значит, предок носителя фамилии звался Кишковаром.

Самый прямой путь — разобрать это прозвище на два корня: «киш» и «(к)овар». Первая часть может восходить к тюркскому «киш» — соболь, куница (в некоторых тюркских языках «киш» — это пушной зверь, ценный мех). Вторая часть — «ковар» — может быть искажением от тюркского «кавар» (или «кабар») — «вести, сопровождать», либо от персидского «кевар» — «берег, край». Однако есть более вероятная версия: «Кишковар» — это сложное прозвище, где «киш» — животное, а «-вар» — суффикс, обозначающий владельца или добытчика (как в «балыквар» — рыбак, «этвар» — мясник). Тогда Кишковар — это «соболевщик», зверолов, промышляющий пушниной, или же человек, торгующий соболями. В пользу этого говорит и то, что фамилии на «-вар» характерны для татарской и башкирской ономастики, где они обозначали ремесло.

Вторая, более прозаическая гипотеза, связывает фамилию с русским диалектным словом «кишка» (в значении «колбаса, потроха»). Тогда «Кишковар» мог быть прозвищем колбасника, варщика кишок. Но это объяснение слабее: суффикс «-ар» в русском языке редко образует названия профессий от таких основ (обычно «-ник»: колбасник, кишочник). К тому же, в говорах «кишковар» не зафиксирован.

Географически фамилия Кишковаров встречается в основном в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Это подтверждает тюркский след: регионы, где пушной промысел (особенно соболь) был традиционным занятием, и где русские фамилии часто образовывались от татарских прозвищ. Скорее всего, первый Кишковаров был либо охотником-соболятником, либо человеком, получившим прозвище по роду занятий в меховой торговле. Фамилия сохранила память о давнем промысле, который кормил его предков.