Фамилия Кишкурная звучит так, будто за ней прячется какое-то меткое прозвище. И это действительно так. В её основе лежит украинское или южнорусское слово «кишкур», которое имеет два основных значения. Первое — «кишка», «внутренности», а второе, переносное, — «скупой человек», «скряга», «жила». В некоторых говорах так называли ещё и плаксу, нытика.

Скорее всего, прозвище Кишкурный получил человек прижимистый, не склонный к тратам, либо, наоборот, тот, кто занимался разделкой туш и продажей требухи. Вторая версия менее вероятна, но тоже имеет право на существование: в диалектах «кишкурить» могло означать «набивать кишки» (то есть делать колбасу). Так что предок мог быть и мясником, и колбасником.

Фамилия образована по типичной восточнославянской модели с суффиксом -н-, который превращает прозвище в прилагательное: Кишкурный человек — человек по прозвищу Кишкур. Окончание -ая — это форма женского рода, характерная для южных и западных регионов Российской империи (Украина, Белоруссия, юг России). В этих местах фамилии часто не склонялись по родам, а давались в женской форме жёнам или вдовам. Поэтому Кишкурная — это либо «жена Кишкурного», либо дочь в семье, где главу звали Кишкур.

Географически фамилия встречается в основном на Украине (особенно в центральных и восточных областях) и в прилегающих областях России. Это редкая фамилия, её носители — в основном потомки крестьян или мещан, получивших фамилию по уличному прозвищу предка. Дворянских корней у неё нет.