Фамилия Клинецкий звучит как типичная «географическая» фамилия, образованная по польско-украинской модели с суффиксом -цкий. Такие фамилии обычно указывали на место, откуда родом человек: владение, село или город с названием, оканчивающимся на -цы, -цк, -ча. В основе фамилии Клинецкий лежит топоним Клинцы или Клинск. На карте есть несколько таких мест: самый известный — город Клинцы в Брянской области (исторически территория Черниговщины, где были сильны польские и украинские влияния), а также деревни Клинцы в Беларуси и на Украине.

Однако у фамилии может быть и прозвищный корень, связанный с ремеслом. В южнорусских и украинских говорах «клинцем» или «клинец» могли называть того, кто делает клинья — например, сапожника (клин в обуви) или кузнеца, изготовлявшего металлические клинья для инструментов. В этом случае фамилия образована от прозвища Клинец («маленький клин» или «тот, кто работает с клиньями») с добавлением типичного фамильного суффикса -ский, который в XVII–XVIII веках часто присваивали выходцам из духовенства или шляхты.

Спорным моментом остаётся национальная окраска фамилии. Суффикс -цкий, а не -ецкий, характерен для польской и белорусской традиции, но встречается и у украинских, и у русских фамилий, особенно на западе и юге России. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования анализируются как типичные для выходцев с западнорусских земель, где польская модель фамилий на -ski была усвоена православным населением. Поэтому Клинецкий с равной вероятностью может быть потомком мелкого шляхтича из-под Клинцов или крестьянина, которого «ополячили» при переписи.

Написание фамилии устойчивое: Клинецкий, без вариантов вроде Кленецкий (от «клён»). Встречается она нечасто, преимущественно в Брянской, Смоленской и Гомельской областях. Ударение, судя по типичному произношению, падает на второй слог: Клине́цкий.