Фамилия Клинковичев — редкий пример отчества, образованного не от личного имени или названия профессии, а от прозвища, связанного с конкретным предметом. В её основе лежит слово «клинок», то есть лезвие холодного оружия (ножа, меча, кинжала). Человек, получивший такое прозвище, мог быть кузнецом, оружейником или просто обладателем острого языка — в русских говорах «клинок» иногда переносилось на бойкого, колкого человека.

Словообразовательная цепочка выглядит так: прозвище Клинок → фамилия Клинкович (патроним на -ович, указывающий на сына или потомка Клинка) → далее с помощью суффикса -ев образована форма Клинковичев. Двойной суффикс — редкая черта. Обычно фамилии на -ичев/-ычев возникали от имён на -ич/-ыч (Ильич — Ильичёв), но здесь исходная форма Клинкович сама по себе уже была отчеством. По сути, Клинковичев — это «внук» Клинка, то есть отчество второй степени, что встречается в основном в северных и вологодских говорах, где такие трёхступенчатые конструкции сохранялись дольше.

В официальных документах XIX века фамилия могла фиксироваться по-разному: Клинковичев, Клинковичов, а иногда и просто Клинкович — путаница возникала из-за того, что писарь отбрасывал «лишний» суффиксальный элемент. Географически фамилия тяготеет к Вологодской и Костромской областям, где встречаются однокоренные прозвища: Клин, Клинков, Клинцов.

Спорных версий здесь немного. Связь с географическим названием (например, деревня Клинково) маловероятна, так как суффикс -ичев указывает именно на личное прозвище, а не на топоним. Единственная альтернатива — что прозвище Клинок дали не за оружие, а за внешность: клином могли называть человека с узким лицом или острым подбородком, но в этом случае фамилия осталась бы Клинков или Клинкин, а не Клинковичев. Таким образом, оружейный или характерологический след — наиболее правдоподобен.