Фамилия Клинковский — одна из тех, чья основа лежит на поверхности, но полное объяснение требует осторожности. Самая прямая версия: она образована от прозвища или некалендарного имени Клинок. В древнерусском языке «клинок» означал не только лезвие холодного оружия, но и узкий, длинный предмет, а также, в переносном смысле, человека острого на язык или пронырливого. Однако топонимическая версия не менее весома: фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Клинки, Клинково или Клинков, которых немало на территории бывшей Речи Посполитой и Российской империи. В этом случае суффикс -ский указывает на дворянское или шляхетское происхождение — такую модель часто использовали для обозначения владельцев поместья или выходцев из определённой местности.

Интересно, что фамилия Клинковский почти не встречается в центральных великорусских губерниях, зато заметна в западных регионах — на Смоленщине, в Беларуси и на Украине. Это косвенно подтверждает её польские или западнорусские корни. Слово «клинок» в польском языке звучит как «klinek», и фамилия Klinkowski там существует, причём иногда с утратой носового звука. Русский вариант Клинковский, скорее всего, результат адаптации польской фамилии или самостоятельного образования по той же модели.

Если отбросить маловероятные версии (например, связь с глаголом «клинкать» в значении «звать» — это диалектизм, не подтверждённый для данной фамилии), то остаётся два равноправных объяснения: прозвище мастера-оружейника или человека с характером «клинка» и географическая привязка. Первое кажется более народным, второе — более аристократичным, но обе версии не исключают друг друга: разные ветви одного рода могли получить фамилию независимо.

По сословной принадлежности Клинковские — это либо мелкопоместная шляхта, либо выходцы из мещан, получившие фамилию по месту жительства. В дворянских родословных книгах фамилия не числится среди столбовых, но встречается в списках служилых людей XVII века на западных рубежах. Сейчас носители фамилии рассеяны по всей России, Украине и Беларуси, но наибольшая плотность сохраняется в Гомельской и Брянской областях.