Фамилия Клоповские — типичный пример того, как географическое название, а точнее, имя собственное от названия населённого пункта, превращается в фамилию целого рода. Суффикс -ск- указывает на дворянское или шляхетское происхождение в Польше, на Украине и в западных губерниях Российской империи. Владельцы имения или выходцы из места под названием Клопово, Клоповка или Клоповичи получали прозвание «Клоповский», которое закреплялось за потомками.

Корень фамилии — «клоп». Вопреки бытовой ассоциации с насекомым, в основе названий поселений чаще лежит не прозвище, а древнерусское нецерковное имя Клоп. Такие имена давали по животным, птицам и насекомым не для унижения, а как обереги: считалось, что «плохое» имя отгонит злых духов и не вызовет зависти. Клоп в этом ряду — то же, что Жук, Комар или Блоха. Поэтому первый носитель имени Клоп мог быть вполне уважаемым человеком, а его потомки, переселившись в другую деревню, становились «Клоповскими» — то есть людьми из рода Клопа или из села Клопово.

В польской ономастике фамилия Klopowski встречается с XVI века. В Речи Посполитой землевладельцы часто брали фамилию по названию своего поместья, и если имение называлось Клопово (от имени основателя), то шляхтич писался как «з Клопова» — Клоповский. В русских губерниях эта фамилия оставалась редкой и преимущественно дворянской, хотя после отмены крепостного права её могли получить и бывшие крепостные, записанные по месту жительства.

Есть и вторая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть как прозвищная, от слова «клоп» в переносном смысле — так могли называть мелкого, назойливого или суетливого человека. Однако для модели на -ский такое происхождение нетипично: прозвища редко превращались в фамилии с этим суффиксом, если только не становились основой для названия деревни. Поэтому версия с географическим названием или именем Клоп выглядит убедительнее.

Написание фамилии — Клоповские, а не Клоповские (с ударением на второе «о») — указывает на множественное число, что характерно для польской традиции, где родовое имя передавалось в форме «Клоповские» (семья Клоповских). В России после унификации документов форма закрепилась в мужском роде как Клоповский, но в истории встречается и исходный вариант.