Фамилия Клопцов образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от прозвища Клопец через притяжательный суффикс -ов. Суффикс указывает на принадлежность: Клопцов буквально означало «сын Клопца» или «человек из рода Клопца». Основа прозвища — слово «клоп». Почему человека могли так назвать? Самое прямое объяснение — внешность: Клопцом в деревнях нередко дразнили невысокого, приземистого мужчину. Но прозвище могло относиться и к характеру. Клоп — насекомое назойливое и кусачее, поэтому Клопцом в шутку называли сварливого, придирчивого человека, с которым лучше не связываться.

Есть и вторая версия, менее очевидная, но тоже имеющая право на существование. Она отсылает к украинскому глаголу «клопотати» — хлопотать, тревожиться, суетиться. В этом случае Клопец — не обидное прозвище, а скорее характеристика старательного, заботливого человека, который вечно в делах и заботах. Такое объяснение раздвигает географию фамилии: её корни могут лежать не только в великорусских говорах, но и в южнорусских или украинских землях.

В любом случае, прозвище Клопец оказалось цепким — оно закрепилось за человеком и со временем, без всяких дополнительных церемоний, превратилось в фамилию Клопцов. Спор о том, что лежит в основе — рост, характер или хлопотливость — остаётся открытым, но именно эта неоднозначность и делает фамилию живой: за ней угадывается не один, а сразу несколько возможных предков.