Фамилия Кловина — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходное слово. С первого взгляда кажется, что в основе лежит корень «клов-», но в русской лексике такого корня нет. Разгадка — в суффиксе -ин, который указывает на принадлежность: Кловина — «дочь или жена Кловы». А вот само прозвище или нецерковное имя Клова — это и есть главная загадка.

Скорее всего, Клова — это фонетический вариант более распространённого имени или прозвища Клава. В русских говорах, особенно северных и сибирских, звук [в] мог заменять [ф] в заимствованных словах, а также возникать на стыке морфем. Клава — это краткая форма от женского имени Клавдия (латинское «хромая»). Однако в фамилиях на -ин часто закреплялись именно прозвищные, обиходные формы: мужчину могли прозвать Клавой (в значении «баловень», «изнеженный человек» или, наоборот, по созвучию с диалектным «клавиться» — кланяться, просить). Женская фамилия Кловина, таким образом, могла образоваться от мужского прозвища Клова, которое было вариантом Клавы.

Менее вероятна, но допустима связь с глаголом «клевать». В этом случае Клова — это «та, кто клюёт» (например, птица, или человек, который постоянно «клюёт носом», или придирчивый едок). Но переход «е» в «о» под ударением после мягкого согласного («клёва») дал бы фамилию Клёвина, а не Кловина. Поэтому версия с Клавой — основная.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северо-западным областям России, где суффикс -ин преобладает над -ов. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, один род дал начало всем носителям. Никакого отношения к слову «кровь» или «кровля» фамилия не имеет — это ложная аналогия, которая возникает при беглом взгляде.