Фамилия Клыченков — редкий пример, где суффикс указывает на происхождение не напрямую от отца, а от прозвища через форму на -а. В основе лежит прозвище Клыча.

Корень «клык» в прозвищах мог указывать на несколько вещей. Самое прямое значение — зубастый человек, либо обладатель крупных, выдающихся передних зубов. Но в диалектах и ремесленной среде слово «клык» имело и переносные смыслы: так называли часть инструмента, зубец, шип, выступ. Поэтому прозвище Клыча мог получить кузнец, плотник или оружейник, работавший с зацепками, крюками, зубьями. Вторая версия — характер: «клыкастый» человек, то есть задиристый, горячий, готовый «показать зубы». В этом случае Клычей могли прозвать воина или драчуна.

Фамилия образована по продуктивной модели: прозвище на -а → притяжательное прилагательное Клычен → суффикс -ов. Схема «Клыча → Клычен → Клыченков» означает «сын Клычи», где Клыча — прозвище отца. Такая цепочка типична для центральных и южных регионов России, где активно использовались прозвищные формы на -а.

Встречается ли фамилия в исторических документах, сказать сложно — она не относится к числу распространённых. Но её однокоренные «родственники» — Клыков, Клычков, Клыченко — фиксируются в разных областях, от Твери до Кубани. Это говорит о том, что прозвище Клыча было не локальным, а бытовало в нескольких диалектных зонах.

Таким образом, предок Клыченковых получил прозвище либо по внешнему признаку (крупные зубы), либо по занятию (ремесленник, имевший дело с зубьями и шипами), либо по крутому нраву. Фамилия закрепилась за его потомками как указание на родство с этим человеком.