Фамилия Клынин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Клынин, скорее всего, образована от аналогичного прозвища, которое восходит к слову "клыня" (в украинском написании "клиння"). Это украинское слово переводится как «клин». Клином в старину называли часть поля, полосу, засеянную одним видом хлеба, или же земельный надел, лесную полосу или участок болота, заросший лесом. Вероятно, основатель рода Клыниных жил близ клина или на клину. К подобным именованиям, которые помогали быстро найти нужного человека в те времена, когда не существовало точных адресов, может относиться и фамилия Клынин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Клынин, со временем получил фамилию Клынин. О точном месте и времени возникновения фамилии Клынин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Клынин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.