Фамилия Княжницына — женская форма мужской фамилии Княжницын. Её основа — слово «княжница». Тут сразу две возможные линии происхождения, и обе ведут в допетровскую Русь.

Первая и самая прямая: княжница — это дочь князя, княжна. Но в русской ономастике фамилии, образованные напрямую от титулов (Князев, Царев), обычно указывали на крепостного или слугу, принадлежавшего этому лицу. То есть Княжницын — это не потомок княжны, а человек, который на неё работал: дворовый, ключник, конюх. Такой способ словообразования с суффиксом -ин типичен для русских фамилий XVI–XVII веков: он отвечал на вопрос «чей?» (чей холоп? — княжницын).

Вторая версия, не менее правдоподобная, связана с мирским прозвищем. В северных и центральных губерниях России «княжницей» могли в насмешку назвать девушку или женщину, которая держалась гордо, требовала к себе особого почтения или наряжалась слишком пышно для своего сословия. Такое прозвище — «Княжница» — закреплялось за человеком, а его дети уже получали фамилию Княжницыны. Модель «прозвище + -ин» — одна из самых массовых в русской антропонимии, и здесь она сработала без участия реального титула.

Стоит обратить внимание на суффикс -ицын. В фамилиях на -ицын (как Курицын, Синицын) ударение почти всегда падает на первый слог: Княжницына. Это окает или акает в произношении, но на письме сохраняет корень «княж-». Встречается вариант написания через «е» — Кнежницына, но он диалектный и редкий.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу и центру России: единичные записи встречаются в писцовых книгах Новгородской земли, а в XIX веке носители фиксируются в Тверской, Ярославской и Вологодской губерниях. Это косвенно подтверждает «служебную» версию: в этих краях было много вотчинных княжеских хозяйств, а значит, и дворовых людей, носивших прозвания по господам.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель на -ицын разбирается как типичная для отчеств от прозвищ и названий лиц женского пола. Княжницын попадает именно в эту категорию — редкую, но лингвистически прозрачную.