Основой фамилии Кочубаров послужило мирское имя Кочубар. Мирское имя Кочубар восходит к аналогичному нарицательному. В некоторых русских диалектах, а также на Украине кочубаром называют хохлатого жаворонка. Давая младенцу такое имя, как Кочубар, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделена эта птица. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Кочубар, со временем получил фамилию Кочубаров.