Фамилия Колбекин — редкий случай, где основа очевидна, а вот её происхождение вызывает вопросы. Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Колбекин — «сын Колбеки» или «человек из семьи Колбекиных». Основа — прозвище Колбека, которое, скорее всего, связано с ремеслом.

Колба в русских говорах могла означать не только лабораторный сосуд, но и деревянную посудину для жидкости, а также нечто вздутое или толстое. Однако в контексте прозвища куда правдоподобнее версия, что Колбека — это человек, делавший колбы, то есть ремесленник, бондарь или стеклодув. В старину прозвища по профессии давали часто: Кузнецов, Мельников, Пономарёв — и Колбекин стоит в этом ряду, хоть и реже встречается.

Суффикс -ин, а не -ов, — тоже деталь, которая может кое-что рассказать. В северных и центральных русских землях (Новгород, Псков, Вятка) фамилии на -ин были более распространены, чем на юге и востоке. Поэтому носители фамилии Колбекин, скорее всего, происходят из северо-западных или северных областей России, где прозвища на -а (Колбека) легко переходили в фамилии на -ин.

Встречается и менее вероятная версия: от тюркского корня «колбек» (родственник, свояк) — но она слаба, так как тюркские заимствования в русских фамилиях обычно дают суффикс -ов (Колбеков), а не -ин. Таким образом, Колбекин — фамилия-профессия, застывшая в форме притяжательного прилагательного, и её носители, скорее всего, потомки ремесленников, работавших с деревом или стеклом.