Фамилия Колодизнер — редкий случай, когда географическая привязка очевиднее, чем этимология. Скорее всего, перед нами вариант фамилии, возникшей на стыке славянской и еврейской ономастических традиций, а точнее — в среде ашкеназских евреев на территории бывшей Речи Посполитой или Российской империи.

Основа фамилии — «Колодиз» — явно восходит к украинскому или белорусскому слову «колодязь» (колодец). В этих языках «колодязь» — привычное обозначение источника воды, и слово это живёт в топонимах: есть сёла Колодязь, Колодезное, речка Колодезь. Суффикс «-нер» — типичный ашкеназский формант, обозначающий профессию или занятие (ср. Шустер — сапожник, Фишер — рыбак). Таким образом, Колодизнер — это «колодезник», то есть человек, который копает колодцы, чистит их или владеет колодцем. В местечках, где центральный колодец был важнейшим объектом, такое прозвище легко закреплялось за семьёй.

Есть и вторая, менее вероятная версия: Колодизнер мог быть образован от названия населённого пункта Колодизно или Колодезное. Такие названия встречаются в Волынской, Гродненской и Киевской губерниях. Если предки переселились оттуда, фамилия работала как указатель на родину: «тот, кто из Колодизного». Однако для топонимических фамилий у ашкеназов чаще использовали суффикс «-ский» (Варшавский, Ковельский), а «-нер» — профессиональный маркер. Поэтому версия с ремеслом убедительнее.

Фамилия не получила широкого распространения. Она осталась локальной, характерной для черты оседлости. Носители Колодизнер в XIX — начале XX века встречаются в переписях городов Волыни и Подолья, реже — в Бессарабии. После эмиграционных волн конца XIX — начала XX века отдельные ветви оказались в США, Аргентине и Израиле, где фамилия сохранилась в искажённых написаниях (Kolodizner, Kolodisner).

Словообразовательная модель проста: основа «колодиз» (от «колодязь») + суффикс деятеля «-нер». Ударение в русском произношении, скорее всего, падает на последний слог — Колодизне́р, хотя в идише могло быть иначе. Фамилия не дворянская, не купеческая — она из среды ремесленников и местечковых жителей, где профессия часто становилась родовым именем.