Фамилия Колоколкин происходит от прозвища Колоколка. В олонецких говорах так называли семенную коробочку конопли и льна. В старину коноплёй крестьяне засеивали поля не только ради волокна, но и как удобрением — она считалась одним из лучших средств для восстановления почвы. А лён-долгунец, древнейшая прядильная культура с более чем 9000-летней историей, до конца XVIII века оставался главным экспортным товаром России. Поэтому прозвище Колоколка, скорее всего, относилось к профессиональным именованиям: так могли назвать крестьянина, который выращивал лён или коноплю, обрабатывал их семенные коробочки.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе «Колоколк-» добавили суффикс принадлежности -ин. В русской антропонимии суффикс -ин указывает на родство: «чей?» — Колоколкин, то есть сын или потомок Колоколки. Эта модель типична для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я: Кузьмин, Ильин, Птицын. В отличие от более распространённых фамилий на -ов/-ев, такие прозвища чаще бытовали в северных и северо-западных говорах, что косвенно подтверждает олонецкое происхождение основы.

Интересно, что фамилия Колоколкин не связана с церковным колоколом или звонарём — это частый случай, когда внешнее сходство слова обманчиво. Однокоренные фамилии (Колоколов, Колокольников) действительно восходят к колоколу как предмету или профессии, но Колоколкин стоит особняком: его корень уходит в крестьянский быт, в хозяйственное слово, которое за пределами Олонецкой губернии было почти неизвестно. Таким образом, по фамилии можно с большой вероятностью определить, что предки носителя жили на Русском Севере и занимались выращиванием прядильных культур.