Фамилия Коломбари — одна из тех, что ломают шаблон: она не славянская по корню, но прочно вписалась в русскую ономастику. Её основа — итальянское слово «colombaia» (голубятня) или «colombaro» (голубятник). В Италии фамилия Коломбари (Colombari) встречается в северных областях — Ломбардии, Венето, Эмилии-Романье. Там она могла указывать на человека, который держал голубей, строил голубятни или жил рядом с ними. Прозвище было ремесленным или топографическим, то есть привязывало человека к месту.

В Россию фамилия попала, скорее всего, с итальянскими мастерами, архитекторами или купцами, которые работали при дворе или в крупных городах в XVIII–XIX веках. Итальянцы активно приезжали строить дворцы, театры и мосты — вспомним архитекторов Растрелли, Кваренги, Росси. Фамилия Коломбари могла закрепиться за потомками такого специалиста, который осел в России. Судя по нетипичному для русских фамилий окончанию, она не русифицировалась — её не переделывали в Коломбарева или Коломбарова, а оставили в исходном виде, что говорит о позднем и единичном появлении.

Словообразовательная модель проста: фамилия образована от прозвища-основы без добавления типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Это характерно для фамилий иностранного происхождения, которые сохранили свою форму при натурализации. В русском языке ударение, как правило, падает на последний слог — Коломбари́.

Других версий происхождения, кроме итальянской, практически нет. Попытки связать фамилию с греческим «коломб» (голубь) или румынским «columbar» (голубятня) ведут к тому же корню — латинскому «columba». Это редкий случай, когда этимология однозначна и не требует сложного разбора. Встречаемость фамилии в России крайне низкая: по открытым данным, носителей — единицы, в основном в Москве и Санкт-Петербурге. Это не массовая фамилия, а скорее «штучный» след итальянской миграции.