Фамилия Коломенкина хранит память о прозвище предка — Коломенка, а вот что именно оно означало, сказать однозначно трудно: у этого слова несколько версий происхождения, и каждая по-своему правдоподобна.

Одна из версий связывает прозвище с диалектным словом «коломень». В Рязанской губернии так называли околицу, околоток или соседство. В этом случае Коломенкой могли прозвать человека, который жил на отшибе, рядом с деревней, или, наоборот, того, кто со всеми соседями ладил. В сибирских говорах у «коломени» другое значение — толпа народа, собравшаяся вокруг чего-то. Здесь прозвище могло указывать на профессию: торговца, зазывалу или скомороха, умевшего привлечь внимание.

Другая, не менее вероятная версия — топонимическая. Фамилия могла возникнуть от названия местности, откуда человек был родом. В Ступинском районе Московской области протекает река Коломенка, на берегу которой стоит город Коломна. Прозвище Коломенка могли дать женщине, переселившейся оттуда. Однако названия с корнем «колом-» (Коломна, Коломенка, Коломино) встречаются по всей Центральной и Северной России — от Оки до Волхова. Это наводит на мысль, что в основе лежит не только название конкретного города, а какой-то более древний термин.

По одной из гипотез, эти названия восходят к литовскому «kalmyne» — «заросли аира». Но ономасты чаще склоняются к финно-угорской основе: «kalm, kolm» означает «смерть» или «могила». В русских говорах закрепилось слово «коломя», а также термины «коломище» и «коломки» — так называли языческие курганные кладбища. Таким образом, прозвище Коломенка могло указывать на место жительства рядом с таким кладбищем или на особенности ландшафта.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе прозвища (Коломенк-) добавился суффикс притяжательности -ин, указывающий на принадлежность «чей?» — Коломенкин. Со временем форма закрепилась, и потомки человека по прозвищу Коломенка стали носить фамилию Коломенкины.