Фамилия Колыба — редкий случай, когда в основе лежит не прозвище и не имя, а конкретный, почти осязаемый предмет. В украинском, белорусском и южнорусском говорах «колыба» — это шалаш, балаган, временное жильё в лесу или в поле, чаще всего у пастухов, лесорубов или сенокосчиков. Слово пришло из румынского и молдавского языков (colibă — хижина) и закрепилось в Карпатском регионе и на юго-западе России. Соответственно, Колыбой могли прозвать человека, который жил в такой постройке, сторожил лес или пас скот, а может быть, и строил эти шалаши для артели.

Модель образования фамилии нетипична для русского ареала. Здесь нет суффикса -ов или -ин — фамилия застыла в чистой форме прозвища, как Колода, Шуба или Сова. Такие «глагольные» или «предметные» фамилии без патронимического оформления чаще встречаются на Украине и в Беларуси. В русской традиции она бы превратилась в Колыбин или Колыбов, но сохранилась в исходном виде, и это указывает на юго-западное или казацкое происхождение.

Версия о связи с глаголом «колыбать» (качать, колыхать) — слабая. Глагол существует, но прозвище «Колыба» от него означало бы «качающийся», что маловероятно для устойчивого именования. Слово «колыбель» тоже родственно, но фамилия от него образовывалась бы иначе — Колыбельников, Колыбельский. Поэтому прямая связь с шалашом остаётся основной и самой логичной.

Географически фамилия встречается в Краснодарском крае, Ростовской области, на Кубани и в Запорожье — то есть в зонах активного переселения запорожских казаков и крестьян из Малороссии. В этих местах слово «колыба» было в ходу до середины XX века, особенно в плавнях и лиманах, где рыбаки и чабаны ставили временные укрытия.

Искать в этой фамилии дворянские корни или громких исторических деятелей не стоит — она из народной среды, из быта людей, чья жизнь проходила под открытым небом. Носитель фамилии Колыба, скорее всего, потомок того, кто не имел постоянного дома и ночевал в шалаше, или того, кто эти шалаши делал для других.