Фамилия Колынин образована от прозвища Колына, которое, скорее всего, восходит к татарскому нарицательному «колын» со значением «жеребенок». Таким образом, можно предположить, что такое прозвище получил человек, занимающийся разведением скота. Таким образом, потомок человека, которого звали Колына, со временем получил фамилию Колынин. Имя Колына, вероятно, является просторечным вариантом имени Николай, которое восходит к греческому Nikolaos, где nika означает «побеждать», а laos – «народ». Соответственно целиком имя Николай переводится как «победитель народов». Одним из святых покровителей имени является Николай Чудотворец (Николай Угодник). Поэтому имя Колына мог получить и ребенок, родившийся на Никольщину. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Колына, со временем получил фамилию Колынин.