Фамилия Колынина — один из тех случаев, когда за одним написанием скрываются две совершенно разные истории происхождения, и обе имеют право на существование. Разбираться с ними лучше всего, отталкиваясь от самого прозвища Колына, которое легло в основу фамилии.

Первая и самая распространённая версия связывает имя Колына с народной, просторечной формой канонического имени Николай. В русских деревнях имя Николай дробилось на множество обиходных вариантов: Никола, Микола, Колюня, и в том числе Колына. Само имя Николай восходит к греческому Nikolaos, где «nika» означает «побеждать», а «laos» — «народ», то есть «победитель народов». Святым покровителем имени считается Николай Чудотворец (Николай Угодник), один из самых почитаемых святых на Руси. Поэтому имя Колына могли дать ребёнку, родившемуся на Никольщину — в период зимних или летних Николиных дней. Скорее всего, основатель рода с таким именем был человеком из крестьянского или посадского сословия, где церковные имена быстро обрастали бытовыми сокращениями.

Вторая версия ведёт происхождение прозвища от тюркского корня. В татарском языке слово «колын» означает «жеребёнок». Прозвища, образованные от названий детёнышей животных, были характерны для тюркских народов и часто указывали на род занятий человека. Колыной могли прозвать конюха, пастуха или просто человека, который имел дело с лошадьми. Эта версия объясняет появление фамилии в регионах Поволжья и Приуралья, где русское и тюркское население веками жило рядом и перенимало бытовую лексику.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Колынин — это «сын Колыны» или «человек из семьи Колыны». Морфологически фамилия проста и прозрачна, что говорит о её относительно позднем оформлении, когда крестьяне массово получали фамилии в XIX веке.

Примечательно, что обе версии сходятся в одном: предок носителей фамилии Колынина был человеком из простонародья. Независимо от того, звали ли его по-домашнему Николаем или прозвали за работу с лошадьми, его имя или прозвище закрепилось в фамилии и дошло до наших дней.