Фамилия Колынин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Колынин послужило церковное имя Николай. Имя Колына, вероятно, является просторечным вариантом имени Николай, которое восходит к греческому Nikolaos, где nika означает «побеждать», а laos – «народ». Соответственно целиком имя Николай переводится как «победитель народов». Одним из святых покровителей имени является Николай Чудотворец (Николай Угодник). Поэтому имя Колына мог получить и ребенок, родившийся на Никольщину. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Колына, со временем получил фамилию Колынин. О точном месте и времени возникновения фамилии Колынин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Колынин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.