Фамилия Комарчук образована по одной из самых продуктивных моделей украинской и польской ономастики — с помощью суффикса -чук. Этот суффикс указывает на принадлежность к роду или происхождение от человека, чьё имя или прозвище легло в основу. В данном случае основой послужило слово «комар» — прозвище, которое в восточнославянской традиции давали либо назойливому, приставучему человеку, либо, наоборот, тому, кто был мал ростом и худощав, как комар. В некоторых говорах «комаром» называли также высокого и тонкого человека — по ассоциации с длинными ногами насекомого.

В отличие от фамилий Комаренко (с более южным, собственно украинским суффиксом) или Комарёв (типично русским), Комарчук указывает на западные регионы — Волынь, Подолье, Галицию, а также на юго-запад Беларуси. Именно там суффикс -чук был особенно распространён в XV–XVII веках, когда шёл процесс закрепления фамилий за крестьянскими и казацкими родами. Встречается и более ранний вариант — Комарчюк, с мягким «ч», что характерно для белорусской фонетики.

Интересно, что фамилия могла возникнуть не напрямую от прозвища, а от имени Комар — языческого дохристианского имени-оберега. В древности называли ребёнка Комаром, чтобы «отвести» от него злых духов: считалось, что имя мелкого, незначительного существа сделает носителя незаметным для болезней и напастей. В этом случае Комарчук — буквально «сын (или потомок) Комара», то есть отчество в третьем поколении.

В польском языке тоже бытует фамилия Komarczuk, что подтверждает её бытование на землях Речи Посполитой. Встречается и вариант Комарчук с ударением на последний слог — так произносится она в украинской среде, тогда как в русском языке ударение чаще падает на второй слог (Комарчу́к), хотя строгого правила нет. В России фамилия редкая, встречается в основном на Кубани и в Ростовской области — регионах, куда в XIX–XX веках переселялись выходцы с Украины.