Основой фамилии Комарькова послужило мирское имя Комарик. Мирское имя Комарик восходит к названию насекомого «комар». Давая младенцу такое имя, как Комарик, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного мира. Комар издревле считался символом тщательности, старательности, добросовестности. Согласно другой версии, в основе фамилии лежит прозвище Комарик, которым прозвали человека, обладающего тонким, звучным голосом. Нередко так называли назойливых и упрямых людей (комар также является символом назойливости). У славян существовало много примет, связанных с этим насекомым: «Много комаров, готовь коробов (по ягоду); много мошек, готовь лукошек (по грибы)», «Комара нет, овса и трав не будет», «Когда появятся комары, пора сеять рожь» и др. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Комарик, со временем получил фамилию Комарькова.